Le Conseil de la MRC se compose du maire de chacune des municipalités locales dont le territoire est compris dans celui de la MRC de Matawinie. Le préfet est élu au suffrage universel par la population de la MRC, ce qui accorde aux citoyens un rôle direct dans le choix de leur représentant régional. Son mandat est d’une durée de quatre ans.
La Commission administrative (CA) est composée du préfet, du préfet suppléant et de trois maires. Plusieurs comités consultatifs sont également actifs et composés de maires. Les membres de la CA et des comités sont élus parmi les maires du Conseil, au mois de novembre, pour un mandat de deux ans, selon les principes de la double majorité, soit 50 % plus une des voix et 50 % plus un de la population des municipalités.
Le Conseil de la MRC définit les grandes orientations et prend les décisions, conformément aux pouvoirs et aux responsabilités qui lui sont confiés par le gouvernement du Québec et les municipalités qui la composent, en fonction des compétences exercées par la MRC. Cette nouvelle approche électorale renforce la participation citoyenne et contribue à une gouvernance régionale plus représentative des priorités et des aspirations de la population de la Matawinie.

Municipalité de Chertsey
Municipalité d'Entrelacs
Municipalité de Notre-Dame-de-la-Merci
Municipalité de Rawdon
Municipalité de Saint-Alphonse-Rodriguez
Municipalité de Saint-Côme
Municipalité de Saint-Damien
Municipalité de Saint-Donat
Municipalité de Saint-Félix-de-Valois
Municipalité de Saint-Jean-de-Matha
Municipalité de Saint-Michel-des-Saints
Municipalité de Saint-Zénon
Municipalité de Sainte-Béatrix
Municipalité de Sainte-Émélie-de-l'Énergie
Municipalité de Sainte Marcelline-de-Kildare